Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
2310003L06RikQ9CV82 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
2310003L06RikQ9CV82 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms