Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms