Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930553M12RikQ9CUH1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms