Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms