Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms