Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NmbQ9CR53 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms