Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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