Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Chchd5Q9CQP3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Chchd5Q9CQP3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Chchd5Q9CQP3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Chchd5Q9CQP3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Chchd5Q9CQP3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Chchd5Q9CQP3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Chchd5Q9CQP3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Chchd5Q9CQP3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Chchd5Q9CQP3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Chchd5Q9CQP3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Chchd5Q9CQP3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Chchd5Q9CQP3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Chchd5Q9CQP3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Chchd5Q9CQP3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Chchd5Q9CQP3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Chchd5Q9CQP3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Chchd5Q9CQP3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Chchd5Q9CQP3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Chchd5Q9CQP3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Chchd5Q9CQP3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd5Q9CQP3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms