Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Nicn1Q9CQM0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Nicn1Q9CQM0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Nicn1Q9CQM0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Nicn1Q9CQM0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nicn1Q9CQM0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nicn1Q9CQM0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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