Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9CQC3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CQC3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CQC3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CQC3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CQC3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9CQC3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9CQC3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9CQC3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms