Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itgb3bpQ9CQ82 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms