Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska1Q9CPV1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms