Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms