Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl17Q9CPR4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms