Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Bcl11bQ99PV8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms