Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms