Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GpnmbQ99P91 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms