Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup155Q99P88 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms