Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bco2Q99NF1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
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