Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rims1Q99NE5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rims1Q99NE5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms