Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hdac9Q99N13 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac9Q99N13 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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