Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms