Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkd1Q99MH6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms