Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
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PtprtQ99M80 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
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PtprtQ99M80 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
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PtprtQ99M80 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
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PtprtQ99M80 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprtQ99M80 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
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