Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd3Q99LY2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdpd3Q99LY2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms