Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp16Q99LG0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp16Q99LG0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms