Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcf2Q99LE6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcf2Q99LE6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcf2Q99LE6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcf2Q99LE6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcf2Q99LE6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcf2Q99LE6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcf2Q99LE6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcf2Q99LE6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcf2Q99LE6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcf2Q99LE6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcf2Q99LE6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcf2Q99LE6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms