Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pagr1aQ99L02 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pagr1aQ99L02 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms