Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms