Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf34Q99KR6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf34Q99KR6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf34Q99KR6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf34Q99KR6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf34Q99KR6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf34Q99KR6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf34Q99KR6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf34Q99KR6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf34Q99KR6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf34Q99KR6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf34Q99KR6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf34Q99KR6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf34Q99KR6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf34Q99KR6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf34Q99KR6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf34Q99KR6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf34Q99KR6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf34Q99KR6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf34Q99KR6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf34Q99KR6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf34Q99KR6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf34Q99KR6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf34Q99KR6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms