Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ciao1Q99KN2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms