Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2aQ99KJ0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms