Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms