Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apobec3Q99J72 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apobec3Q99J72 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms