Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctu1Q99J10 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms