Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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Rnf144aQ925F3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Rnf144aQ925F3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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Rnf144aQ925F3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf144aQ925F3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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