Protein–RNA interactions for Protein: Q923W1

Tgs1, Trimethylguanosine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgs1Q923W1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tgs1Q923W1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgs1Q923W1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms