Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim7Q923T7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim7Q923T7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms