Protein–RNA interactions for Protein: Q923S6

Neurl1, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1Q923S6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Neurl1Q923S6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neurl1Q923S6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms