Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Spdl1Q923A2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spdl1Q923A2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms