Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca5Q91ZW3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms