Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

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Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nek8Q91ZR4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nek8Q91ZR4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms