Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx18Q91ZR2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms