Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Klc3Q91W40 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klc3Q91W40 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms