Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp3Q91W36 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms