Protein–RNA interactions for Protein: Q91V61

Sfxn3, Sideroflexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn3Q91V61 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sfxn3Q91V61 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sfxn3Q91V61 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sfxn3Q91V61 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sfxn3Q91V61 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn3Q91V61 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn3Q91V61 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn3Q91V61 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn3Q91V61 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn3Q91V61 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn3Q91V61 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn3Q91V61 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn3Q91V61 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn3Q91V61 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn3Q91V61 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn3Q91V61 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn3Q91V61 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn3Q91V61 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms