Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms