Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV0

Itgbl1, Integrin beta-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgbl1Q8VDV0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Itgbl1Q8VDV0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgbl1Q8VDV0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms