Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8VCE4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8VCE4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8VCE4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VCE4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VCE4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q8VCE4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VCE4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VCE4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VCE4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VCE4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q8VCE4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VCE4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VCE4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VCE4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VCE4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VCE4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VCE4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q8VCE4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VCE4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VCE4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8VCE4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VCE4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VCE4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VCE4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VCE4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VCE4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VCE4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8VCE4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms