Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rapgef3Q8VCC8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rapgef3Q8VCC8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rapgef3Q8VCC8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rapgef3Q8VCC8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rapgef3Q8VCC8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rapgef3Q8VCC8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rapgef3Q8VCC8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rapgef3Q8VCC8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rapgef3Q8VCC8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rapgef3Q8VCC8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rapgef3Q8VCC8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rapgef3Q8VCC8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rapgef3Q8VCC8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rapgef3Q8VCC8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rapgef3Q8VCC8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rapgef3Q8VCC8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rapgef3Q8VCC8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rapgef3Q8VCC8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rapgef3Q8VCC8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rapgef3Q8VCC8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rapgef3Q8VCC8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rapgef3Q8VCC8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rapgef3Q8VCC8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rapgef3Q8VCC8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rapgef3Q8VCC8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rapgef3Q8VCC8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rapgef3Q8VCC8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Rapgef3Q8VCC8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rapgef3Q8VCC8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rapgef3Q8VCC8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rapgef3Q8VCC8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rapgef3Q8VCC8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rapgef3Q8VCC8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rapgef3Q8VCC8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
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